Trois nouveaux variants à propagation rapide du virus SARS-CoV-2 sont apparus dans le monde: le variant britannique B.1.1.7, le variant brésilien P.1 et le variant sud-africain B.1.351.

3 nouveaux variants SARS-CoV-2

Mutations populaires pour la protéine spike

 

Ces 3 lignées portent la mutation N501Y et semblent être apparues indépendamment les unes des autres. Elles appartiennent à la lignée “mère” B.1, issue de la mutation D614G apparue peu après le début de l’épidémie à Wuhan. Ces mutations convergentes, en particulier les N501Y et E484K (partagées entre B.1.351 et P.1) sont d’un grand intérêt, car elles peuvent être la cause de l’augmentation de la transmissibilité.

Les mutations de ces souches se produisent également dans la protéine de la nucléocapside, qui est couramment utilisée comme biomarqueur dans les tests antigéniques rapides. Il est essentiel d’évaluer si les tests antigéniques commerciaux actuels peuvent détecter les protéines N mutées avec la même sensibilité et spécificité que leur homologue de type sauvage. Ces protéines peuvent également servir de cibles aux anticorps neutralisants en cours de développement.

SARS-CoV-2 S protein, His Tag, Super stable trimer

SARS-CoV-2 S protein, His Tag, Super stable trimer (MALS & NS-EM verified, #SPN-C52H9)

 

Un large panel de variants de protéine RBD / Spike et nucléocapside recombinants portant les mutations susmentionnées est disponible comme ci-dessous :

Mutations du Variant B.1.1.7 en Angeterre

Mutations du Variant B.1.351 en Afrique du Sud

 

Mutations du Variant P.1 au Brésil

 

Mutations du Variant du Vison au Danemark

Mutation à Haute Fréquence de la Nucléocapside

 

Domaine conservé de la nucléocapside du SARS-CoV-2

 

Pour aller plus loin

1. Détection de nouveaux variant du SARS-CoV-2 (Angleterre, Brésil et Afrique du Sud) avec les kits Norgen RT-PCR de détection COVID19 TaqMan

Référence Description Quantité
DXTM67100 2019-nCoV TaqMan RT-PCR Kit Dx 50 réactions
DxTM67120 2019-nCoV TaqMan RT-PCR Kit Dx 500 réactions
DxTM67200 COVID-19 TaqMan RT-PCR Kit (E/RdRP genes) Dx 500 réactions
TM67100 2019-nCoV TaqMan RT-PCR Kit 50 réactions
TM67120 2019-nCoV TaqMan RT-PCR Kit 500 réactions
TM67240 COVID-19 TaqMan RT-PCR Kit (E/RdRP genes) 40 réactions

 

2. Production de variant

Référence Description Quantité
VG40589-UT SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike ORF mammalian expression plasmid 1 unité
15071 Muta-Direct™ Site-Directed Mutagenesis Kit 15 reactions
FP318 LipoFectMax™ 3000 Transfection Reagent 750µL
30081-T Firefly & Renilla Luciferase Single Tube Assay Kit 50 assays

 

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